先端生物计算有限公司

商业资讯

我们致力与为您解决与生物信息学有关的问题

本公司以计算机药物设计研发,蛋白质相互作用预测,基因组大数据分析三个领域为事业核心。我们拥有满足所有这些领域需求的尖端独自技术。作为东京工业大学认证的创业公司,我们与日本国内外的大学,研究机关等有着紧密的联系,致力于开拓将先端技术与产业需求迅速连接的新市场。

计算机药物设计研发

我们通过大规模的分子动力学模拟对靶标蛋白质进行药物结合亲和力预测,对大量的药物候补化合物进行虚拟筛选,对药物-靶标蛋白质进行相互作用预测。公司拥有与机器学习(PKRank等)和虚拟筛选(Spresso)相关的独自技术。
  • CPathPred
    CPathPred

    基于物理化学特征的药物代谢途径预测

  • Spresso
    Spresso

    通过片段化进行高速的化合物预筛选

  • PKRank
    PKRank

    基于排序学习的虚拟筛选

我们接受使用东京工业大学开发的各种软件(药物代谢途径预测“CPathPred”,种子化合物筛选“Spresso”,基于机器学习的筛选“PKRank”)进行的药物研发业务,受托研发业务,研究咨询业务,人力资源培训业务等业务。

 

关联文献(计算机药物设计研发)

蛋白质相互作用预测

我们使用最先进的高性能蛋白质-蛋白质对接软件MEGADOCK来进行数百万规模的蛋白质-蛋白质相互作用预测。同时,我们在蛋白质复合体的立体构造预测,以及与蛋白质复合体相关的目标识别领域拥有丰富的经验。

*本公司拥有MEGADOCK商用版本的东京工业大学独家授权。

  • MEGADOCK
    MEGADOCK

    基于超级计算的蛋白质相互作用预测

  • MEGADOCK-Web
    MEGADOCK-Web

    基于蛋白质三级结构数据的蛋白质相互作用预测结果数据库

我们接受使用东京工业大学开发的MEGADOCK进行的蛋白质相互作用预测业务,利用蛋白质相互作用预测结果数据库MEGADOCK-Web进行的蛋白质相互作用解析业务,受托研发业务,研究咨询业务,人力资源培训业务等业务。

关联文献(蛋白质相互作用预测)

基因组大数据分析

我们使用世界最高速的高灵敏度序列同源性分析软件(GHOSTZ)进行大规模(16S/WGS)的基因组数据分析。此外,我们还有对于口腔内,肠道内,环境宏观基因组分析方面的丰富经验。

※本公司拥有GHOSTZ商用版本的东京工业大学独家授权。

  • GHOSTX
    GHOSTX

    比BLAST快100倍的高速序列同源性搜索工具

  • GHOSTZ
    GHOSTZ

    比BLAST快200倍的高速序列同源性搜索工具

  • GHOSTZ-GPU
    GHOSTZ-GPU

    利用GPU进行计算,GHOSTZ-GPU是比GHOSTZ更快5~7倍的高速序列同源性搜索工具

我们接受使用东京工业大学开发的GHOST进行的基因组数据分析业务,受托研发业务,研究咨询业务,人力资源培训业务等业务。

关联文献(基因组大数据分析)

软件受托研发

我们承接生物/药物数据处理、AI分析、数据库构建、网络服务化、云端实现等软件定制开发。

示例:

  • 含有小分子化合物物性和活性自动解析功能的数据库系统
  • 支持HELM记法的肽分子设计支持系统
  • 基于各类实验条件的实验设计支持AI系统
  • 利用开源软件(OSS)开发的创新药物支持工具

计算机系统的设计以及贩卖

我们还提供适用于药物研发领域的AI应用和模拟计算的工作站及服务器环境的建议和构建。

示例:

  • 用于运行AlphaFold2和分子动力学模拟的GPU服务器
  • 用于ESM和Chemformer等蛋白质/化合物语言模型AI的规格建议

研发咨询与调查

在IT药物研发和生物信息学领域拥有丰富知识的研究人员将为您提供研发咨询和调查服务。

人才培养与教材销售

我们提供IT药物研发和生物信息学相关的人才培训讲座,并承接教材开发。

讲座和学术研讨会的计划与运营

我们策划和运营与IT药物研发及生物信息学相关的研讨会和国际研讨会。

(过往成果)
AHeDD2019/IPAB2019 联合研讨会
加速电子药物发现的人工智能和分子模拟趋势
https://ahedd2019.ahead-biocomputing.co.jp/en/